两者之间的联系主要表现为：
1.工作目标的一致性。不论被审计单位，还是审计单位的工作都是经济管理工作的一部分。工作中，都是以国家的有关法律、法规及规章制度为依据，向有关利益方面提供真实、可靠的财务会计信息，维护利益各方合法权益。所以，工作目标是一致的。
2.客观基础的同一性。不论被审计单位还是审计单位，都是根据同一个企业已经实现了的经济活动履行各自的职能。就是说，两者反映和监督的都是同一会计主体的经济活动。所以，它们的客观基础是一致的。
四、附带说明的几个问题
1.注册会计师为履行职责，必须以应有的责任感和严肃的态度执行审计业务，对被审计单位的财务会计报表，应结合其他相关的会计资料依法、依规进行审查，编制具有法律效力的审计报告，同时对出具的审计报告负责。但是，不能把注册会计师当作被审计单位的会计报告合法性、合规性的保证人。比如，注册会计师在出具审计报告后，又发现被审计单位有个别重大事项（如某些重要资产处置事项、或有事项等）没有在会计资料上反映，这种情况注册会计师在审计中难以发现，但导致了审计报告信息失真的后果。如果把这种后果全部归过于注册会计师，就不公正了。应该说，负主要责任的应是会计单位。
2.企业为了经营管理的需要，通常会编制一些前景财务资料，如未来年度盈利预测、资本预算、现金流量预测等，为了增强说服力，往往聘请注册会计师进行审核并出具审计报告。日后因经过审核后的前景资料对投资人造成了误导，其责任归谁负？这里应说明的是，对于企业前景财务资料的审计不是注册会计师的工作内容，而是注册会计师职责以外的会计服务，对于编制不实的会计材料误导了投资人造成的不良影响，理应由当事人负责。