《中国科学》刊登论文551篇，其中科学基金资助项目的论文391篇，占71??0%。《科学通报》刊登论文518篇，其中科学基金资助项目的论文323篇，占62??4%。
2003年度国家最高科学技术奖授奖2人，其中刘东生院士是我国地球环境科学研究领域的专家，他使中国在古全球变化研究领域中跻身世界前列，他曾受过自然科学基金多项计500余万元的资助。
国家自然科学一等奖是国家科技奖励中的高等级奖项，自1956年至今我国先后仅有9次颁发过国家自然科学一等奖。2003年国家自然科学奖授一等奖1项，获奖人陈均远、侯先光、舒德干曾获得科学基金约18个相关项目的支持；授二等奖18项，其中16项(15项内地获奖成果)的获奖人均曾不同程度地获得国家自然科学基金资助。
此前2002年度国家自然科学一等奖获得者为蒋锡夔院士、计国桢教授带领的课题组，获奖项目为“物理有机化学前沿领域的两个重要方面———有机分子簇集和自由基化学的研究”，经过了20年的研究，这个项目从1985年开始获得国家自然科学基金的支持，18年间从没有间断过经费资助。