（一）加强公共卫生体系建设
1、提高应对突发疾病预防控制体系建设。加强州、县（市）各级疾病预防控制机构和基层预防及妇幼保健组织建设，依法强化医疗机构疾病预防控制的责任；建立功能完善、反应迅速、运转通畅的疫情信息网络；加强疾病预防控制机构实验室检测能力，到2010年传染病疫情管理达到：传染病疫情报告的准确率达80%以上，及时率90%以上，漏报率低于5%，报告发病率与实际发病率的误差率在5%以内；明确各级疾病预防控制机构的职能、责任，加强人员队伍建设，加强各级疾病预防控制机构的能力建设。
2、医疗救治体系建设。按照统一规划，统一设置，统一管理和统一指挥的原则，到2010年，建立和完善包括紧急救援中心、传染病院在内的功能齐全，安全迅速、处置有力的医疗救治体系，完善县级综合医院急诊科，进一步加强急救能力建设，不断提高急救工作的及时性和有效性。
3、健全突发公共卫生事件应急机制和突发公共卫生事件监督信息网络体系。突发公共事件报告及时率在90%以上，及时处置率100%；完善重大传染病疫情、突发公共卫生事件监测、医疗救治信息、卫生监督执法信息和突发公共卫生事件应急指挥系统建设，全面提高突发公共卫生事件监测、反应、救治、监督指挥决策的能力。
（二）做好重大疾病的防治和妇幼卫生工作
1、贯彻落实《传染病防治法》；加强鼠疫、霍乱、结核病、疟疾、艾滋病、麻风病和非典、人感染高致病性禽流感等重点传染病的预防控制、监测、预测预警。
── 建立突发传染病疫情的有效应急处置机制，完善疫情报告网络。加强和巩固鼠疫防治联防和鼠害联防工作，避免人间鼠疫的发生；完善霍乱外环境的监测和肠道传染病门诊监测制度，及时发现病例的输入和掌握流行动态；加强虫媒传染病和寄生虫病的防治，乡以上医疗卫生机构对疟疾病人实施规范化治疗和镜检，确保不发生较大的疫情暴发；加强麻风病的防治，最大限度搜索发现病人，开展联合化疗覆盖率达100%，规范服药率在95%以上，全州麻风病患病率控制在1/10万以下；继续巩固消灭脊髓灰质炎工作，以农村为重点，坚持常规免疫为基础，建立冷链运行新机制，争取在2010年计划免疫疫苗接种率以乡（镇）为单位达到并维持在90%以上，保持无脊髓灰质炎状态；提高乙肝疫苗首针及时接种率和全程免疫接种率，控制乙肝、麻疹等传染性疾病暴发流行；抓好碘缺乏病等地方病防治，全面推进消除碘缺乏病目标的实现。
──全面贯彻《艾滋病防治条例》，落实国家“四免一关怀”政策和云南省“一办法六工程”，进一步加大防治艾滋病工作力度，各县（市）人民政府要把预防与控制艾滋病工作纳入当地经济和社会发展规划及精神文明建设范畴，完善由政府领导负责和有关部门参加的预防与控制艾滋病的领导组织或协调会议制度。全民普及艾滋病防治知识，到2010年，全民预防艾滋病知识知晓率城市达到100%，农村达到95%以上，高危人群达100%。 建立健全艾滋病监测体系，到2010年，县级疾控中心建立功能完善的艾滋病初筛实验室，州疾控中心建立确认实验室；在现有医疗机构中完善一所具备为艾滋病病人和艾滋病病毒感染者提供规范化治疗、护理、咨询和预防保健服务能力的医院。进一步制定和完善预防与控制艾滋病方案措施。明确各部门、社会各方面在艾滋病控制中的责任，保障艾滋病病人和艾滋病病毒感染者的权利和义务；同时进一步加强血液安全管理工作，杜绝血源性的艾滋病传播，力争无偿献血率达95%，成分血使用率达95%以上。
──加强呼吸道传染病的防治工作，根据《西双版纳州结核病防治规划（2002-2010年）》实施要求，建立结核病防治可持续发展机制，全面实施现代结核病控制策略，落实结核病归口管理和督导治疗。到2010年，全州实施现代结核病控制策略覆盖率达95%以上；涂阳病人治愈率达80%以上；乡村医生结核病防治技术培训率达85%以上。
2、建立健全慢病防治和监测工作网络，广泛开展群众性教育，倡导良好生活行为，改善各族群众的生活质量，提高群众自我保健意识和健康水平；积极开展社区卫生服务，控制全州慢病发病率及死亡率的上升趋势，到2010年，全州患病人群管理率达50%，并逐步建立健康档案，强化干预活动和疾病人群管理等对前期慢病综合防治的工作措施。
3、充分发挥各级妇幼保健机构的组织、管理、指导和服务功能，做好妇幼保健工作，重点筛查和治疗严重危害妇女、儿童健康的疾病，降低孕产妇和婴儿死亡率。到2010年，全州农村孕产妇保健覆盖率以县为单位达到90%以上，孕产妇住院分娩率达70%以上，孕产妇死亡率和婴儿死亡率在“十五”期间的基础上分别下降25%和20%。一般乡（镇）卫生院具备处理顺产的能力，县级医疗、妇幼保健机构及乡（镇）中心卫生院具备处理难产的能力。继续实施“降消”项目，提高基层卫生服务能力，提高住院分娩率，确保孕产妇的生育安全。降低5岁以下儿童死亡率，降低出生缺陷发生率，积极防治儿童多发病和常见病，加强儿童疾病综合管理，促进母乳喂养，改善儿童营养状况；开展出生缺陷防治宣传教育活动，做好产前诊断和孕期保健以及新生儿疾病筛查和儿童保健工作。